<head>
<script>
if(navigator.userAgent.indexOf('iPhone') != -1) {
    location.href="http://www.hogehoge.com/iphone/";
}
</script>
</head>

↑のコードをデスクトップ向けトップページ(index.html)のhead要素内に記述しておくと、iPhoneから「http://www.hogehoge.com/」にアクセスした時に、「http://www.hogehoge.com/iphone/」に自動転送される。


参考書籍:HTML5+CSS3で作る  魅せるiPhoneサイト  iPhone/iPad/iPod touch対応
HTML5+CSS3で作る 魅せるiPhoneサイト